10-го октября 1918г. Народный Комиссариат по просвещению выдал Клименту Аркадьевичу Тимирязеву Охранную грамоту, удостоверяющую, что библиотека учёного, находящаяся в доме 2 кв. 29 по Шереметьевскому переулку «реквизиции не подлежит, равно как и помещение, ею занятое».
Основанием открытия музея явилось Постановление ВЦИК в связи с кончиной (1920г.) одного из величайших учёных 19 века К.А. Тимирязева, в постановляющей части которого сказано: «...сохранить в неприкосновенности кабинет, библиотеку и рукописи К.А.Тимирязева».
30-го августа 1924 года за № 7941 Президиум Московского Совета Раб. Крест.и Красноарм. Депутатов постановил «не производить никаких выселений или уплотнений в квартире К.А.Тимирязева (ул. Грановского, д.2, кв.29).
Музей учёного - единственный в России, был организован согласно Приказа Наркомпроса РСФСР №299 от 26 мая 1942 года под названием «Кабинет-музей К.А.Тимирязева» и являлся филиалом Биологического музея им. К.А.Тимирязева.
Согласно Постановления Совета Министров РСФСР от 27 апреля 1946 года за №278 филиал Биомузея им.К.А.Тимирязева, находящийся в мемориальной квартире учёного, был преобразован в самостоятельный музей К.А.Тимирязева и передан в ведение Московской Сельскохозяйственной Академии им.К.А.Тимирязева (ныне Российский Государственный Аграрный Университет - Московская Сельскохозяйственная Академия им.К.А.Тимирязева), в чьём ведении и находится в настоящее время.
Уникальность данного музея состоит не только в неповторяемости, невозобновляемости и незаменимости той обстановки, предметов и вещей, среди которых творил великий учёный, но и как памятник культуры является свидетелем духовного образа жизни ушедшего поколения.
Это позволяет музею формировать национальное и индивидуальное сознание, а также осознание места нашего народа, и личности в частности, внутри ценностей мировой цивилизации.
Постановлением Совета Министров РСФСР от 30 августа 1960 года №327 музей включён в список памятников культуры общесоюзного значения как выдающийся памятник истории и науки и состоит под охраной государства. Охранный знак имеется.
Мемориальный музей-квартира К.А.Тимирязева включён в Международный справочник «Культурные учреждения мира», который издаётся в Англии.
Музей осуществляет следующие виды деятельности:
■ разработка научного наследия К.А.Тимирязева;
■ ведение культурно-просветительской работ(организация специальных выставок, пропаганда через мемориальную экспозицию жизни и творчества К.А.Тимирязева, публикации в периодической печати,выступления на научных конференциях и семинарах, издание новых исследовательских данных о жизни К.А.Тимирязева и его окружении);
■ чтение лекций студентам РГАУ-МСХА им. К.А.Тимирязева в помещении музея и в академии;
■ поисковая деятельность в архивах РФ;
■ предоставление экспонатов музея по запросам различных учебно-научных учреждений Москвы и Московской области;
■ поддержание связей с музеями и библиотеками России.
Посетителями музея являются школьники, студенты, научные работники и пенсионеры.
Указом Президента РФ от 11 сентября 2008 года №1343 РГАУ-МСХА им.К.А.Тимирязева включён в Государственный свод особо ценных объектов культурного наследия народов Российской Федерации.